RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 MORC1Q86VD1 984 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 EHD3Q9NZN3 535 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 KELP23276 732 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CNGA1P29973 690 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NDUFV1P49821 464 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 FKBP10Q96AY3 582 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PANK3Q9H999 370 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NCAPD2Q15021 1401 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRC-204ENST00000367379 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC154A6NI56 674 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 F5H697 171 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TRIAP1O43715 76 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-204ENST00000367379 PTGER1P34995 402 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 MTHFSP49914 203 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NEK8Q86SG6 692 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CNTD1Q8N815 330 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ATL2Q8NHH9 583 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 RLIMQ9NVW2 624 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 DKK3Q9UBP4 350 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ITGB4P16144 1822 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-204ENST00000367379 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 F2RL2O00254 374 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 JUPP14923 745 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 ITPK1Q13572 414 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 BMPR2Q13873 1038 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 KAT5Q92993 513 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 REPS1Q96D71 796 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MKS1Q9NXB0 559 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHGA12O60330 932 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SOAT2O75908 522 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MMP10P09238 476 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 EBLN1P0CF75 366 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 CYP2C19P33261 490 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 TUBA4AP68366 448 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MORN5Q5VZ52 161 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB9Q96C00 473 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 GPR35Q9HC97 309 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 UBR3Q6ZT12 1888 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF213O14771 459 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 IKBKBO14920 756 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MOSPD3O75425 235 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 CHEK2O96017 543 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 CERS1P27544 350 aa6□□□□□ -1.45
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