RNA–Protein interactions for RNA: YLR405W

DUS4, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS4, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS4	YLR405W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
DUS4	YLR405W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YCR085W	P25650	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	UGX2	P32772	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	VHS2	P40463	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	FIP1	P45976	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	GLO1	P50107	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	AIM11	P87275	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RRG8	Q06109	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	LCB3	P47013	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	SPS100	P13130	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	DSE2	P38844	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YGR025W	P53216	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	AIM34	Q03673	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	Q0255	P03881	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	POR2	P40478	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YGR039W	P53225	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	COX12	Q01519	83 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	ABF2	Q02486	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	CCW14	O13547	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RAD6	P06104	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	NRG2	P38082	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YIA6	P40556	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	CWP2	P43497	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YDL186W	P48568	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	MID2	P36027	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	PRM7	Q12459	698 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	ENV10	Q99382	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	ATP15	P21306	62 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	VPS55	P47111	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YGR219W	P53307	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DUS4	YLR405W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	MRPS12	P53732	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YML122C	Q03207	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	DCV1	P43595	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	VMA11	P32842	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	MIC12	P38341	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	PEX17	P40155	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YCH1	P42937	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	KEG1	P43614	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YNL190W	P53872	204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	SMP1	P38128	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YHR022C	P38763	256 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	AIM19	P40502	157 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YIL059C	P40520	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YIR020C	P40575	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YJR146W	P47174	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YLR415C	O13578	112 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YHL042W	P38729	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	INO2	P26798	304 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	KNH1	P50112	268 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	TOS8	P53147	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	CAX4	P53223	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DUS4	YLR405W	ECM12	O13529	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	ERG28	P40030	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	PBA1	Q05778	276 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	TRP1	P00912	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	YBR209W	P38311	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	SHU1	P38751	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	YER135C	P40082	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DUS4	YLR405W	HUR1	P45820	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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