RNA–Protein interactions for RNA: YGR246C

BRF1, Transcript of TFIIIB B-related factor, yeast

Gene BRF1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRF1	YGR246C	YML122C	Q03207	126 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	AGA1	P32323	725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YNL198C	P40166	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	CCW12	Q12127	133 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	VMA11	P32842	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	MST28	P39552	234 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YPT53	P36019	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	KEG1	P43614	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	ELC1	Q03071	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YNL184C	P53876	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRF1	YGR246C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YHR022C	P38763	256 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.09	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	VAR1	P02381	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	TOA2	P32774	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YGR025W	P53216	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	SCW10	Q04951	389 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	PEX22	P39718	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YER181C	P40097	107 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YNL217W	P40152	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	VPS55	P47111	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	SPG4	Q04438	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	AIM11	P87275	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	CCW14	O13547	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YEL067C	P39978	195 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	DCV1	P43595	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	OST2	P46964	130 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	TOS8	P53147	276 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YNR077C	P53758	84 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	HOR7	Q05827	59 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YPR013C	Q12145	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	PRM7	Q12459	698 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	PRM3	Q08931	133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	MEC1	P38111	2368 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YER135C	P40082	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YGR039W	P53225	103 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	SHH4	Q06236	168 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YJR146W	P47174	117 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	MSA1	Q08471	629 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	SRL1	Q08673	210 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	TEL1	P38110	2787 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BRF1	YGR246C	Q0255	P03881	472 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	SIM1	P40472	476 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YPS5	P53057	165 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	CAX4	P53223	239 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	TRP1	P00912	224 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	ATP15	P21306	62 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	MIG3	P39943	394 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YLR042C	Q07990	161 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
BRF1	YGR246C	PEX17	P40155	199 aa		4	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	RRT13	P40042	185 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	CDC43	P18898	376 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	QCR8	P08525	94 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	ATX1	P38636	73 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	SBH1	P52870	82 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	MRPS12	P53732	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BRF1	YGR246C	HPA2	Q06592	156 aa		3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.1 ms