RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 POLIQ9UNA4 740 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL16O15467 120 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CLSTN1O94985 981 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 C8AP07357 584 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9A1P19634 815 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF75DP51815 510 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 GCNT1Q02742 428 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR72Q3MJ13 1102 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DNASE1L2Q92874 299 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP58Q9BVL2 599 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DSEQ9UL01 958 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SPEGQ15772 3267 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 M0QZQ0 153 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HRO43593 1189 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 POU2F2P09086 479 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ODC1P11926 461 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CNR2P34972 360 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NEK11Q8NG66 645 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SENP8Q96LD8 212 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SYN3O14994 580 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 AP5Z1O43299 807 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HUS1O60921 280 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TYMPP19971 482 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 FIGNQ5HY92 759 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CLSTN3Q9BQT9 956 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SIX2Q9NPC8 291 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 GDE1Q9NZC3 331 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB8Q9UN66 801 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TACC1O75410 805 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCL12P48061 93 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CUL2Q13617 745 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RTP2Q5QGT7 225 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 VSTM4Q8IW00 320 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 APPL2Q8NEU8 664 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 LMAN1LQ9HAT1 526 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SCN1AP35498 2009 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 IGF2RP11717 2491 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 NOTCH4Q99466 2003 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CYB561D2O14569 222 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP11A1P05108 521 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC25BP30305 580 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ASPAP45381 313 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MFAP3P55082 362 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM14Q14142 442 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SCARA3Q6AZY7 606 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RABGGTAQ92696 567 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 GANQ9H2C0 597 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UCHL3P15374 230 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 BRCC3P46736 316 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 LRMPQ12912 555 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PDXDC1Q6P996 788 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL23Q86XA0 190 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FMNL3Q8IVF7 1028 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 HASPINQ8TF76 798 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ING5Q8WYH8 240 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TATDN2Q93075 761 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ELSPBP1Q96BH3 223 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MMS19Q96T76 1030 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP72Q9P209 647 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ADCY5O95622 1261 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FGFR3P22607 806 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SATB1Q01826 763 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.1■■□□□ 1.61
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