RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LY75	O60449	1722 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	OVOL3	O00110	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXN1	O15353	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MARCH6	O60337	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ERLIN1	O75477	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GNA14	O95837	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GYS1	P13807	737 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNE1	P24864	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP14	P50281	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY7	P51828	1080 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF11	P52732	1056 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GPSM2	P81274	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	DGCR2	P98153	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	UBXN1	Q04323	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	BRD3	Q15059	726 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT31	Q15323	416 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	DGKD	Q16760	1214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	DPF2	Q92785	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CUL5	Q93034	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TSG101	Q99816	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRM-215	ENST00000583289		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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