RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRK7Q8WTQ7 553 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FMO2Q99518 471 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNPY3Q9BT09 278 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRHL1Q9NZI5 618 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TJP3O95049 919 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC6A3Q01959 620 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PPP1R7Q15435 360 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TFDP3Q5H9I0 405 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP58Q5T655 872 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LHX8Q68G74 356 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQCKQ8N0W5 287 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZWILCHQ9H900 591 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GABRDO14764 452 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT10P13645 584 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCK1P35558 622 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FLT3P36888 993 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CDKN2BP42772 138 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGEF6Q15052 776 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WSCD1Q658N2 575 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRNP1Q6NT89 227 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZDHHC24Q6UX98 284 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATL2Q8NHH9 583 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC2A14Q8TDB8 520 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RXFP2Q8WXD0 754 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADAM2Q99965 735 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RSAD1Q9HA92 442 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYLDQ9NQC7 956 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CACNG4Q9UBN1 327 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CAPN15O75808 1086 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GABBR2O75899 941 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDGFRAP16234 1089 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MIPP30301 263 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL34P49207 117 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLCNKBP51801 687 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT17Q04695 432 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KAZNQ674X7 775 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SENP8Q96LD8 212 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZIM3Q96PE6 472 aa27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GAS8O95995 478 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SKIP12755 728 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADCY2Q08462 1091 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMC3Q7Z5M5 1100 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PGBD4Q96DM1 585 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RUFY1Q96T51 708 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SH3GL2Q99962 352 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPYSL4O14531 572 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLTPP55058 493 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMTNL2Q2TAL5 461 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCUBE3Q8IX30 993 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNS4Q8IZW8 715 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF169Q8NCN4 708 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM129AQ9BZQ8 928 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP18Q9UMW8 372 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAN1Q9Y2M0 1017 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A1W2PQY0 241 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OPA1O60313 960 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRAP2O75791 330 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CKBP12277 381 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSD17B3P37058 310 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRMT2P55345 433 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTK6Q13882 451 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM86AQ8N2M4 240 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC114Q96M63 670 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRPV6Q9H1D0 765 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FRMPD3Q5JV73 1810 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF40O75150 1001 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TKTP29401 623 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GRK4P32298 578 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCNN1AP37088 669 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACADSBP45954 432 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MTMR3Q13615 1198 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNT1Q5JUK3 1230 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FBXO25Q8TCJ0 367 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSFY1Q96LI6 401 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCSK1NQ9UHG2 260 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CASTOR2A6NHX0 329 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP2C2O75185 946 aa27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms