RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 DMAC2Q9NW81 257 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-209ENST00000567771 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-209ENST00000567771 GMEB2Q9UKD1 530 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-209ENST00000567771 WNT6Q9Y6F9 365 aa27.14■■□□□ 1.94
SPNS1-209ENST00000567771 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa27.14■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 HDCP19113 662 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 GJA4P35212 333 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 GALK1P51570 392 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CACNA2D1P54289 1103 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PSMD2Q13200 908 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 BIRC3Q13489 604 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 LONP2Q86WA8 852 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SH3RF2Q8TEC5 729 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA32Q96LK8 384 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 C8orf48Q96LL4 319 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TTLL2Q9BWV7 592 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 KCTD10Q9H3F6 313 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM30AQ9NV96 361 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RAB23Q9ULC3 237 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 HPSEQ9Y251 543 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRDP23468 1912 aa27.13■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 EGFP01133 1207 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TGM1P22735 817 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CLDN10P78369 228 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 AMPD2Q01433 879 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SLC9A9Q8IVB4 645 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CPA6Q8N4T0 437 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa27.12■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CLDN5O00501 218 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 IFNAR2P48551 515 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CDH8P55286 799 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 NOP14P78316 857 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ZXDBP98169 803 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 EML3Q32P44 896 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 P2RY13Q9BPV8 354 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 B3GNT5Q9BYG0 378 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SMYD3Q9H7B4 428 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 VRTNQ9H8Y1 702 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PARD6AQ9NPB6 346 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DLL3Q9NYJ7 618 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 USP25Q9UHP3 1055 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DMXL1Q9Y485 3027 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 VNN1O95497 513 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TCF3P15923 654 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 HOXA6P31267 233 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CNR2P34972 360 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 AP3M2P53677 418 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DLG4P78352 724 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF699Q32M78 642 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 LAIR1Q6GTX8 287 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM174Q8WUU8 243 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ATP2A3Q93084 1043 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ELOVL4Q9GZR5 314 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 LINC00597Q9H2U6 94 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 EHD2Q9NZN4 543 aa27.1■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CEP250Q9BV73 2442 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF840PA6NDX5 716 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PDXKO00764 312 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RNF40O75150 1001 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 CLSTN1O94985 981 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RAP1GAPP47736 663 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PDE6CP51160 858 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 KRT85P78386 507 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 NCOA4Q13772 614 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF667Q5HYK9 610 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 WDR5BQ86VZ2 330 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 USP18Q9UMW8 372 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DNAH14Q0VDD8 3507 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 NR3C1P04150 777 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 MYL1P05976 194 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PFKLP17858 780 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 DRD1P21728 446 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 PPP3CCP48454 512 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 TAF10Q12962 218 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 RNF38Q9H0F5 515 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 SDCBP2Q9H190 292 aa27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SPNS1-209ENST00000567771 LEFTY2O00292 366 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 ATG13O75143 517 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 ABL1P00519 1130 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 RETP07949 1114 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 PRR29P0C7W0 189 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 SYKP43405 635 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 PXNP49023 591 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 NDUFA8P51970 172 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-209ENST00000567771 SPEM2Q0P670 501 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms