RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-205ENST00000502260 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-205ENST00000502260 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2-205ENST00000502260 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-205ENST00000502260 USP25Q9UHP3 1055 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-205ENST00000502260 INVSQ9Y283 1065 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-205ENST00000502260 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 GBP1P32455 592 aa14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 CUL4BQ13620 913 aa14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 CDH9Q9ULB4 789 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1W2PQ27 194 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1W2PQ64 194 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A1W2PQD8 194 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 LEFTY2O00292 366 aa14.75□□□□□ -0.05
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SH3BP2-205ENST00000502260 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 PROS1P07225 676 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-205ENST00000502260 BCKDHBP21953 392 aa14.75□□□□□ -0.05
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