RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 TAF12Q16514 161 aa26.98■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 AAK1Q2M2I8 961 aa26.98■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 NECTIN4Q96NY8 510 aa26.98■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 NOTCH4Q99466 2003 aa26.98■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 RHOP08100 348 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 SLC8A3P57103 927 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 NTHL1P78549 312 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 MTMR3Q13615 1198 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 VSTM4Q8IW00 320 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 UBA3Q8TBC4 463 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 ASAH2Q9NR71 780 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.97■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 A0A1W2PQJ5 194 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 M0QYV0 167 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 CYP11B1P15538 503 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 PKDCCQ504Y2 493 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 NUP93Q8N1F7 819 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 LEMD2Q8NC56 503 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 LRRC3Q9BY71 257 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 FAM50BQ9Y247 325 aa26.96■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 CLUHO75153 1309 aa26.95■■□□□ 1.91
TSC2-208ENST00000461648 SETSIPP0DME0 302 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PDE6CP51160 858 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZNF75DP51815 510 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 EPHA5P54756 1037 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PDE4CQ08493 712 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 MEA1Q16626 185 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TMC8Q8IU68 726 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 GPIHBP1Q8IV16 184 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 POMKQ9H5K3 350 aa26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 LRRC53A6NM62 1247 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 HHLA1C9JL84 531 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TNFRSF10BO14763 440 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 MYL4P12829 197 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 FERP16591 822 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 MYRFLQ96LU7 910 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 EHD2Q9NZN4 543 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PCDHGC3Q9UN70 934 aa26.94■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 GYPCP04921 128 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 CFHP08603 1231 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 FSHRP23945 695 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 KRT9P35527 623 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 SLC5A3P53794 718 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ARID5AQ03989 594 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TRIM14Q14142 442 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PIGZQ86VD9 579 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 EPS8L1Q8TE68 723 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TTLL2Q9BWV7 592 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 COMMD8Q9NX08 183 aa26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 COL6A3P12111 3177 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TULP2O00295 520 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZNF197O14709 1029 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 FGF19O95750 216 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 CCDC172P0C7W6 258 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PLA2G4AP47712 749 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 KCNQ1P51787 676 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 USP46P62068 366 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 ZBED6P86452 979 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 TAF3Q5VWG9 929 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TSC2-208ENST00000461648 IL21Q9HBE4 155 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms