RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NME7Q9Y5B8 376 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5DP30049 168 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRF5Q13568 498 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD10Q14728 455 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 QPCTQ16769 361 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLRA4Q5JXX5 417 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTN3Q9P232 1028 aa19.63■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf60A6NFR6 353 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RECQL4O94761 1208 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD2P08910 425 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDGFRAP16234 1089 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKDCCQ504Y2 493 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICALCLQ6ZW33 695 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC30AQ86WT1 665 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RXFP2Q8WXD0 754 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP6Q96FZ7 201 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGA2Q9UJY4 613 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHOC2Q9UQ13 582 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCNTO95613 3336 aa19.62■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDC80O14777 642 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS7P49802 495 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDF10P55107 478 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM17P78536 824 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAT4Q14765 748 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4F22Q6NT55 531 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PMF1Q6P1K2 205 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFX6Q8HWS3 928 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB3Q8WWF6 145 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALN1Q9BXU9 219 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGALS13Q9UHV8 139 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJD2Q9UKL4 321 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRAP2O75791 330 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOC2P02655 101 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB6CQ53S08 254 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf57Q5W0N0 161 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM40Q8WWA1 233 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf88Q9H8K7 445 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSAD1Q9HA92 442 aa19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH16O75309 829 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENDOD1O94919 500 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DRD4P21917 467 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP5P24588 427 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AXLP30530 894 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC142Q17RM4 750 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLFML1Q6UWY5 402 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPM1EQ8WY54 764 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC77Q9BR77 488 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOL6Q9BWW8 343 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC4A5Q9BY07 1137 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC134Q9H6E4 229 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF19AQ9NV58 838 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAS3O00219 553 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETSIPP0DME0 302 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSEN2P49810 448 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX17Q15036 470 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDO1Q16878 200 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOWAHAQ2M3V2 549 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNC93AQ86WB7 457 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC25Q96NG3 672 aa19.6■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TREHO43280 583 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB1P16220 341 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH6P55285 790 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPLX4Q7Z7G2 160 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCGF5Q86SE9 256 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM110Q86TL2 294 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4X1Q8N118 509 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6B3Q8NGW1 331 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSAD2Q8WXG1 361 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EURLQ9NYK6 297 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa19.59■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPYSL4O14531 572 aa19.58■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPSAP2O60256 369 aa19.58■□□□□ 0.73
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPP00450 1065 aa19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms