RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm281D3Z1Y0 860 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3252E9PUT9 216 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm6588E9Q3K0 461 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3468E9QAJ8 216 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mroh4G3X8W1 983 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mup13L7N222 235 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Myl1P05977 188 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pou3f3P31361 497 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dpep1P31428 410 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Uchl4P58321 233 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 VcpQ01853 806 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc85aQ5SP85 500 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tfdp2Q64163 446 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 EfsQ64355 560 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tbc1d12Q6A039 696 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Foxo6Q70KY4 559 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Arhgef33Q8BW86 850 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dus1lQ8C2P3 475 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fbxl5Q8C2S5 690 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Uba6Q8C7R4 1053 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc159Q8C963 411 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kcnc4Q8R1C0 628 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fam49bQ921M7 324 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gimap4Q99JY3 219 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnf135Q9CWS1 417 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gfra4Q9JJT2 260 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Msl3Q9WVG9 525 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ggt5Q9Z2A9 573 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 UtrnE9Q6R7 3430 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Apol7bB1AQP7 369 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5795E9PZN8 263 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zfr2E9Q5M4 874 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppm1aP49443 382 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pon1P52430 355 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Neurog2P70447 263 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cct5P80316 541 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q3TQQ9 903 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Apol7eQ3UZ24 369 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcf4Q60722 670 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Foxn1Q61575 648 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CyldQ80TQ2 952 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q80Y73 168 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AA792892Q8C6S1 278 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Calcoco1Q8CGU1 691 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Smtnl2Q8CI12 456 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ankrd54Q91WK7 299 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Foxp3Q99JB6 429 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 RpainQ9CWY9 219 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Caln1Q9JJG7 219 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Egfl7Q9QXT5 275 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tk2Q9R088 270 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Taf1Q80UV9 1891 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bfsp1A2AMT1 669 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ssxb9A2BI93 185 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prpmp5E9PXN1 296 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9857F7CXR1 130 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdh9F8VPK8 1237 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ptpn9O35239 593 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fgf15O35622 218 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rdh7O88451 316 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Casp14O89094 257 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fgfr1P16092 822 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Glb1P23780 647 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Marcksl1P28667 200 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ercc5P35689 1170 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Acsl1P41216 699 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 HpdP49429 393 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cav1P49817 178 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Msx3P70354 204 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sox8Q04886 464 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igsf9Q05BQ1 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Echdc2Q3TLP5 296 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q3UTZ3 580 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cfhr2Q4LDF6 332 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vps41Q5KU39 853 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc117Q6PB51 277 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Aoc2Q812C9 757 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.3 ms