Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT1

Bfsp1, Filensin, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp1A2AMT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Bfsp1A2AMT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Bfsp1A2AMT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Bfsp1A2AMT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Bfsp1A2AMT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Bfsp1A2AMT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Bfsp1A2AMT1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Bfsp1A2AMT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Bfsp1A2AMT1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Bfsp1A2AMT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Bfsp1A2AMT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Bfsp1A2AMT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Bfsp1A2AMT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Bfsp1A2AMT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Bfsp1A2AMT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Bfsp1A2AMT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Bfsp1A2AMT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Bfsp1A2AMT1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Bfsp1A2AMT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Bfsp1A2AMT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Bfsp1A2AMT1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Bfsp1A2AMT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Bfsp1A2AMT1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Bfsp1A2AMT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Bfsp1A2AMT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Bfsp1A2AMT1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Bfsp1A2AMT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Bfsp1A2AMT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Bfsp1A2AMT1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bfsp1A2AMT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bfsp1A2AMT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Bfsp1A2AMT1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Bfsp1A2AMT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Bfsp1A2AMT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Bfsp1A2AMT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Bfsp1A2AMT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Bfsp1A2AMT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Bfsp1A2AMT1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Bfsp1A2AMT1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Bfsp1A2AMT1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Bfsp1A2AMT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Bfsp1A2AMT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Bfsp1A2AMT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Bfsp1A2AMT1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Bfsp1A2AMT1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Bfsp1A2AMT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Bfsp1A2AMT1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Bfsp1A2AMT1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Bfsp1A2AMT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Bfsp1A2AMT1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bfsp1A2AMT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bfsp1A2AMT1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bfsp1A2AMT1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bfsp1A2AMT1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bfsp1A2AMT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Bfsp1A2AMT1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bfsp1A2AMT1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bfsp1A2AMT1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bfsp1A2AMT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bfsp1A2AMT1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Bfsp1A2AMT1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bfsp1A2AMT1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bfsp1A2AMT1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bfsp1A2AMT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Bfsp1A2AMT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bfsp1A2AMT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bfsp1A2AMT1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Bfsp1A2AMT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bfsp1A2AMT1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bfsp1A2AMT1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Bfsp1A2AMT1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bfsp1A2AMT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bfsp1A2AMT1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bfsp1A2AMT1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bfsp1A2AMT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bfsp1A2AMT1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bfsp1A2AMT1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bfsp1A2AMT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bfsp1A2AMT1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bfsp1A2AMT1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bfsp1A2AMT1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bfsp1A2AMT1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bfsp1A2AMT1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bfsp1A2AMT1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Bfsp1A2AMT1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bfsp1A2AMT1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Bfsp1A2AMT1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Bfsp1A2AMT1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Bfsp1A2AMT1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bfsp1A2AMT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bfsp1A2AMT1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Bfsp1A2AMT1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bfsp1A2AMT1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Bfsp1A2AMT1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bfsp1A2AMT1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bfsp1A2AMT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bfsp1A2AMT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bfsp1A2AMT1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bfsp1A2AMT1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bfsp1A2AMT1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms