RNA–Protein interactions for RNA: YLR405W

DUS4, Transcript of Dihydrouridine synthase, yeast

Gene DUS4, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUS4	YLR405W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	CTR2	P38865	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	PET8	P38921	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YER181C	P40097	107 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	SDH7	Q04401	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	DAD1	Q12248	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	FMP27	Q06179	2628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	VAR1	P02381	398 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	COX10	P21592	462 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	TIR2	P33890	251 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YKR041W	P36134	250 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YFL065C	P43539	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YFL051C	P43552	160 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	NCA3	P46955	337 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	HST4	P53688	370 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YMR103C	Q04436	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
DUS4	YLR405W	DIF1	O13577	133 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YMR141C	P40211	102 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DUS4	YLR405W	YKR032W	P36127	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YKR045C	P36138	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MOH1	P38191	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YER121W	P40076	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MST27	P53176	234 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	SED1	Q01589	338 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	HPA2	Q06592	156 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MSA1	Q08471	629 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YDL009C	Q12210	107 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	RRT1	P38192	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YHR130C	P38834	111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MBB1	P39534	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YER085C	P40058	173 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MGR2	Q02889	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YLR112W	Q12130	139 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	JID1	Q12350	301 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YHR213W	P0CI67	198 aa		5	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	GPI18	P38211	433 aa		5	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	GPI19	Q04082	140 aa		5	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YPL261C	Q08976	102 aa		5	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YHR140W	P38842	239 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YER076C	P40049	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YIP1	P53039	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YIP3	P53633	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YNL234W	P53857	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	TIM10	P87108	93 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	PFY1	P07274	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	OXA1	P39952	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	ATP23	P53722	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	IRC23	Q08416	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YKL070W	P36087	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YEL067C	P39978	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
DUS4	YLR405W	YFR057W	P43625	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YNR077C	P53758	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	FCY1	Q12178	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DUS4	YLR405W	KRE1	P17260	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YHL037C	P38733	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	IMP2	P46972	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YNL046W	P53956	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	GLE2	P40066	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YNL217W	P40152	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	TOS6	P48560	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YGL260W	P53056	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	UBC7	Q02159	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	IES6	P32617	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	COX17	Q12287	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	TIM22	Q12328	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	PHO85	P17157	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	AGA1	P32323	725 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	SBH2	P52871	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	TOA2	P32774	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DUS4	YLR405W	SPI1	P40092	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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