RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS21A	YKR057W	SDH7	Q04401	133 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RXT3	Q07458	294 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RNH203	Q12338	110 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	ISD11	Q6Q560	94 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	INO4	P13902	151 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	TIR2	P33890	251 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YER076C	P40049	302 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YER181C	P40097	107 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YFL065C	P43539	102 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	NRM1	P53718	249 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	NUP53	Q03790	475 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YPR203W	Q08994	102 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	VAR1	P02381	398 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPL39	P04650	51 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	PCL2	P25693	308 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	AGA1	P32323	725 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	ATX1	P38636	73 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YHR140W	P38842	239 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	OXA1	P39952	402 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	SPI1	P40092	148 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YFR057W	P43625	151 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YAR1	P46683	200 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	TOS6	P48560	102 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	MST27	P53176	234 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	KRE1	P17260	313 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RRT1	P38192	103 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
RPS21A	YKR057W	YIP1	P53039	248 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YIP3	P53633	176 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YNL234W	P53857	426 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	HPA2	Q06592	156 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	TIM22	Q12328	207 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	JID1	Q12350	301 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YNL217W	P40152	326 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	ATP23	P53722	227 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	EOS1	P53938	366 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YPL229W	Q99395	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	PHO85	P17157	305 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YHR130C	P38834	111 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	CTR2	P38865	189 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YFL051C	P43552	160 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	AIM11	P87275	137 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	ERF2	Q06551	359 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	IRC23	Q08416	157 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	IGO2	Q9P305	131 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPS21A	YKR057W	MOH1	P38191	138 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YHL037C	P38733	133 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	LCB3	P47013	409 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	SED1	Q01589	338 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	UBC7	Q02159	165 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	PRM7	Q12459	698 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.58	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	Q0255	P03881	472 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YER085C	P40058	173 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	FIP1	P45976	327 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	GLO1	P50107	326 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YGR025W	P53216	100 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	MRPS12	P53732	153 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YNL046W	P53956	172 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	AIM34	Q03673	198 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	RRG8	Q06109	277 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
RPS21A	YKR057W	CCW14	O13547	238 aa		2.56	□□□□□ -2

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