RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
SSZ1	YHR064C	YJL213W	P40896	331 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	YKR032W	P36127	104 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	YKR041W	P36134	250 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	MST28	P39552	234 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	TIM22	Q12328	207 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSZ1	YHR064C	YER181C	P40097	107 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	TOS6	P48560	102 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	UBC7	Q02159	165 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	MOH1	P38191	138 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	SNF11	P38956	169 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YER076C	P40049	302 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	GLE2	P40066	365 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	GEP3	Q08622	556 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	TEL1	P38110	2787 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YFL051C	P43552	160 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	IES6	P32617	166 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YKL070W	P36087	169 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YNL217W	P40152	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	ABM1	P47146	123 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	ATP23	P53722	227 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	PRM3	Q08931	133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	HFA1	P32874	2273 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	CTR2	P38865	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	SPI1	P40092	148 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	DIA1	P54005	336 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	SED1	Q01589	338 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	ATX1	P38636	73 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	POR2	P40478	281 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	LCB3	P47013	409 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YIP3	P53633	176 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	JID1	Q12350	301 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	IRA2	P19158	3079 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YNL234W	P53857	426 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSZ1	YHR064C	PHO85	P17157	305 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	OXA1	P39952	402 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YER121W	P40076	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	OST2	P46964	130 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YGR219W	P53307	113 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YNR077C	P53758	84 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	HPA2	Q06592	156 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	CCW14	O13547	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	VAR1	P02381	398 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	GLO1	P50107	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	MSA1	Q08471	629 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	INO4	P13902	151 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	CDC43	P18898	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	AGA1	P32323	725 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	COX10	P21592	462 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YEL067C	P39978	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	SNA4	Q07549	140 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	IRC23	Q08416	157 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	MIC12	P38341	106 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YNL092W	P53934	400 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	FCY1	Q12178	158 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	YFR057W	P43625	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	SBH2	P52871	88 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	KEG1	P43614	200 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	AIM11	P87275	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SSZ1	YHR064C	CCW12	Q12127	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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