RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	IGO2	Q9P305	131 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	BET1	P22804	142 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	TIM12	P32830	109 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	MET32	Q12041	191 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		2.96	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SFT2	P38166	215 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	LST8	P41318	303 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YFR054C	P43622	192 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YDR209C	Q03480	137 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	USV1	Q12132	391 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YDR102C	Q03864	110 aa		2.95	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	CCH1	P50077	2039 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YNL217W	P40152	326 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	EMC6	Q12431	108 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.94	□□□□□ -1.94	not detected
XRS2	YDR369C	DSE2	P38844	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SIM1	P40472	476 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		2.94	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	ROX3	P25046	220 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YHR173C	P38864	112 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PAU7	P39545	55 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YER187W	P40102	141 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	GAT4	P40569	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YNR077C	P53758	84 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	IRC23	Q08416	157 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SPO24	Q3E752	67 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	FPR2	P32472	135 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SWD3	P38123	315 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YSY6	P38374	65 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YEL067C	P39978	195 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YFL051C	P43552	160 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YGR050C	P53231	118 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YOR387C	Q08910	206 aa		2.93	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YLR302C	O13544	120 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PCL2	P25693	308 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	MED6	P38782	295 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	GLO1	P50107	326 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	UBC13	P52490	153 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PIR1	Q03178	341 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	MIX14	Q04341	121 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PFY1	P07274	126 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPB10	P22139	70 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YHR180W	P38868	163 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YIA6	P40556	373 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YLR112W	Q12130	139 aa		2.92	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PCL5	P38794	229 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	TIM17	P39515	158 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	SWS2	P53937	143 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PET191	Q02772	108 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	YPR064W	Q12492	139 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	PIR5	P46999	287 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	CUZ1	P53899	274 aa		2.91	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.9	□□□□□ -1.94
XRS2	YDR369C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	PET8	P38921	284 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	PEX17	P40155	199 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	AIM19	P40502	157 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YFL019C	P43576	117 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	ATP23	P53722	227 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YNL234W	P53857	426 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	VPS68	Q12016	184 aa		2.9	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	CTR2	P38865	189 aa		2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	NCA3	P46955	337 aa		2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	TIM22	Q12328	207 aa		2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	RRT15	Q3E811	62 aa		2.89	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	PGU1	P47180	361 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	NRM1	P53718	249 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	MGR2	Q02889	113 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	PPT2	Q12036	173 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.88	□□□□□ -1.95
XRS2	YDR369C	MTC6	P38849	526 aa		2.88	□□□□□ -1.95

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