RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFHX4Q86UP3 3567 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 DCLK1O15075 740 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2C2O75185 946 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 IDEP14735 1019 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PMLP29590 882 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX1P48742 406 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 DMC1Q14565 340 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL6Q6IPX3 200 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3RF2Q8TEC5 729 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEAL3Q969E4 200 aa27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD3A2A2Y4 597 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 APBB3O95704 486 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM191BP0C7N4 346 aa27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM171BQ6P995 826 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC4Q96A65 974 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS45Q9NRW7 570 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087X0B3 334 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 TXLNAP40222 546 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD2Q13200 908 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ALCAMQ13740 583 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ACDQ96AP0 544 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00597Q9H2U6 94 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 EML5Q05BV3 1969 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO2P25791 158 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA11P43364 429 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNB1Q14721 858 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 GPD1LQ8N335 351 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 FSIP1Q8NA03 581 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5B17Q8NGF7 314 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 MYLPFQ96A32 169 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT15Q9BQS2 421 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 CRTAC1Q9NQ79 661 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 PANK4Q9NVE7 773 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF3P15923 654 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ZXDBP98169 803 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 ELF2Q15723 593 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PANK2Q9BZ23 570 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS13Q9NVM9 706 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ANTXRLA6NF34 631 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 HDCP19113 662 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 STAT6P42226 847 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 USP46P62068 366 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1EQ12965 1108 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf50Q6ZRC1 276 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GLIS3Q8NEA6 775 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 HPDLQ96IR7 371 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH9Q9ULB4 789 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SDK1Q7Z5N4 2213 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 BDNFP23560 247 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 OPRD1P41143 372 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKEP52429 567 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CREB5Q02930 508 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1H3Q13133 447 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 RNF43Q68DV7 783 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DPH6Q7L8W6 267 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CBWD2Q8IUF1 395 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA17Q96L03 361 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 INVSQ9Y283 1065 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG2BQ96BY7 2078 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 SEC13P55735 322 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SHC2P98077 582 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GAB4Q2WGN9 574 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM1Q6UX27 236 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TSTD1Q8NFU3 115 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 USP33Q8TEY7 942 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 EDEM2Q9BV94 578 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TPSD1Q9BZJ3 242 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG17Q6Q759 2223 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 K7EQS6 105 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 LEFTY2O00292 366 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NFATC1O95644 943 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CAVIN2O95810 425 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP1P32455 592 aa27.41■■□□□ 1.98
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