RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	BMP15	O95972	392 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTN1	P12814	892 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GAP43	P17677	238 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT2	P35908	639 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ECE1	P42892	770 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	AP3M2	P53677	418 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ACY1	Q03154	408 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF543	Q08ER8	600 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAM15	Q13444	863 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF2H3	Q13889	308 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC39A14	Q15043	492 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	STK38	Q15208	465 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	NPY5R	Q15761	445 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MMEL1	Q495T6	779 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	FUT11	Q495W5	492 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	AVL9	Q8NBF6	648 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	C3orf20	Q8ND61	904 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFRSF25	Q93038	417 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CGREF1	Q99674	301 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	XKR8	Q9H6D3	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	BARHL2	Q9NY43	387 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	COX16	Q9P0S2	106 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MALT1	Q9UDY8	824 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		7.14	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MYH4	Q9Y623	1939 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM75P	A6NK02	468 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	IDH3B	O43837	385 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA2G6	O60733	806 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SIN3B	O75182	1162 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SOAT2	O75908	522 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	HEXB	P07686	556 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ASNS	P08243	561 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MYZAP	P0CAP1	466 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	COL6A2	P12110	1019 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ALAS1	P13196	640 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ADH6	P28332	368 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC16A2	P36021	539 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	GPC3	P51654	580 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PMS2	P54278	862 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC26A5	P58743	744 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TNP2	Q05952	138 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX1	Q13596	522 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPA	Q15257	358 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	OCLN	Q16625	522 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ALG11	Q2TAA5	492 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	LETM2	Q2VYF4	491 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX35	Q5T0J7	233 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.13	□□□□□ -1.27
FBXO38-208	ENST00000504971	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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