RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 F5P12259 2224 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TGFB1I1O43294 461 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 EXOC3O60645 756 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ATP2C2O75185 946 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 BDNFP23560 247 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 LMO2P25791 158 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 HOXD13P35453 343 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 IFNAR2P48551 515 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 FNTBP49356 437 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 LMNB2Q03252 620 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CYP24A1Q07973 514 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CCINQ13939 588 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 MTF1Q14872 753 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 LPAL2Q16609 132 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CPA6Q8N4T0 437 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TRIM66O15016 1216 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CASP1P29466 404 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SPATA17Q96L03 361 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 HPS4Q9NQG7 708 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 FAM163BP0C2L3 166 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 HDCP19113 662 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP8P85298 464 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 NR1H3Q13133 447 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CUL4BQ13620 913 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CCDC142Q17RM4 750 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 RESP18Q5W5W9 173 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CEP68Q76N32 757 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ATP2A3Q93084 1043 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-212ENST00000484841 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TACC1O75410 805 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 ATICP31939 592 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 BIRC3Q13489 604 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PCED1BQ96HM7 432 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 EXOC1Q9NV70 894 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 A8MXQ7 604 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 K7ESF4 209 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TADA3O75528 432 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 ABL1P00519 1130 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PFKLP17858 780 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 DRD1P21728 446 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PPP3CCP48454 512 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 AP3M2P53677 418 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 EHHADHQ08426 723 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 ECT2Q9H8V3 914 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PTPRDP23468 1912 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 RETP07949 1114 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 SLFN14P0C7P3 912 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 DMWDQ09019 674 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 SPEM2Q0P670 501 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 PSMD2Q13200 908 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 ZNF77Q15935 545 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 FBXO43Q4G163 708 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 WDR44Q5JSH3 913 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A12Q96S37 553 aa21.49■■□□□ 1.03
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