RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 BRIP1Q9BX63 1249 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 KLK15Q9H2R5 256 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SMOC2Q9H3U7 446 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ARFGAP3Q9NP61 516 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 COL20A1Q9P218 1284 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 NEU2Q9Y3R4 380 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 INSL6Q9Y581 213 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 CEP83Q9Y592 693 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 A0A087WWL8 130 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 A0A1W2PS29 197 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM43BA6NCK2 446 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 VWC2LB2RUY7 222 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RASA4BC9J798 803 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 APOL1O14791 398 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RASA4O43374 803 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 THAP12O43422 761 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 NCK2O43639 380 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 C1QL1O75973 258 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RHOP08100 348 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ELFN1P0C7U0 828 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PPP3CBP16298 524 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 KLRC1P26715 233 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SERPINB3P29508 390 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TM4SF4P48230 202 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 CARSP49589 748 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ARFIP2P53365 341 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ITGA8P53708 1063 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MAPK10P53779 464 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 LOXL3P58215 753 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 LILRA4P59901 499 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF543Q08ER8 600 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 GRM1Q13255 1194 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 DYRK1AQ13627 763 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MGAT5BQ3V5L5 792 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 FAM209BQ5JX69 171 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 CACHD1Q5VU97 1274 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TAF2Q6P1X5 1199 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf228Q6PIY5 440 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RNF44Q7L0R7 432 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MICU3Q86XE3 530 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 LNX2Q8N448 690 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa2.95□□□□□ -1.94
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PTPRC-208ENST00000427110 SNX19Q92543 992 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 MSLNLQ96KJ4 702 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SNX22Q96L94 193 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SGCZQ96LD1 299 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 DPH1Q9BZG8 443 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SERHLQ9NQF3 203 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 STARD7Q9NQZ5 370 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TBC1D23Q9NUY8 699 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 INTS13Q9NVM9 706 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ETAA1Q9NY74 926 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 HESX1Q9UBX0 185 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF212Q9UDV6 495 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SHOC2Q9UQ13 582 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ADM5C9JUS6 153 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 F5H697 171 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RAB27BO00194 218 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TRIAP1O43715 76 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SOAT2O75908 522 aa2.94□□□□□ -1.94
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PTPRC-208ENST00000427110 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 SETSIPP0DME0 302 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 CYP2C9P11712 490 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 TSHRP16473 764 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ABCB4P21439 1286 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 VIPR2P41587 438 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 NPTX2P47972 431 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RARRES1P49788 294 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 NDUFV1P49821 464 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 PRKAG1P54619 331 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 WNT3P56703 355 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 C21orf58P58505 322 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRC-208ENST00000427110 RPS7P62081 194 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
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