RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	HED1	Q03937	162 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	SFT2	P38166	215 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	BLM10	P43583	2143 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	COX18	P53239	316 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	COA2	Q3E823	68 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	CCW14	O13547	238 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YHR140W	P38842	239 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	OXA1	P39952	402 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	NCA3	P46955	337 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ALG14	P38242	237 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	CPD1	P53314	239 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPB9	P27999	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGR050C	P53231	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YDR114C	Q04597	100 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YLR118C	Q12354	227 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	GSC2	P40989	1895 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MRS3	P10566	314 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	CDC43	P18898	376 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PPT2	Q12036	173 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ROX3	P25046	220 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGL230C	P53074	147 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RAV2	Q03956	351 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPS1	P32329	569 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	CRH1	P53301	507 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	TOM7	P53507	60 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	Q0255	P03881	472 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	AHT1	P29589	182 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YKL102C	P34249	101 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YFR057W	P43625	151 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PIR5	P46999	287 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGR151C	P53287	111 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YIL059C	P40520	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	AYT1	Q12226	474 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YOX1	P34161	385 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MBB1	P39534	108 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PMP3	P87284	55 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YHR130C	P38834	111 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PCP1	P53259	346 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YDR215C	Q12240	137 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YMR31	P19955	123 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	UTR5	P32630	166 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	SPC1	P46965	94 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YCR006C	P25350	157 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	EGT2	P42835	1041 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RXT3	Q07458	294 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	FIT2	Q08906	153 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	CYC3	P06182	269 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	PBA1	Q05778	276 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	USV1	Q12132	391 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	ATO3	Q12359	275 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	TSC3	Q3E790	80 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RPL39	P04650	51 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	DSE2	P38844	325 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YLR042C	Q07990	161 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	TIM18	Q08749	192 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	TIM22	Q12328	207 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YKL044W	P36092	106 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YHR022C	P38763	256 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YGR269W	P40326	108 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YIP3	P53633	176 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	QRI5	P32344	111 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	RTG1	P32607	177 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	CSH1	P38287	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	VPS71	Q03433	280 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	YOL118C	Q08259	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	PEX4	P29340	183 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	POR2	P40478	281 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	ATP19	P81451	68 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RRP5	YMR229C	AIM11	P87275	137 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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