RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	YER188W	P40103	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	MPM1	P40364	252 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RPR2	P40571	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YGL118C	P53132	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RSM10	Q03201	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RCE1	Q03530	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ATG5	Q12380	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RAD6	P06104	172 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	HAP3	P13434	144 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	COX10	P21592	462 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	SDH3	P33421	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	GTT1	P40582	234 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	BOL2	P53082	120 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	SYM1	Q06563	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	SGA1	P08019	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ASK1	P35734	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
YMD8	YML038C	API2	Q04413	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	GAL83	Q04739	417 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ANT1	Q06497	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RRT7	Q07829	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YIL086C	P40503	102 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	PAM16	P42949	149 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YFR045W	P43617	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	TVP15	Q03860	143 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	GPI18	P38211	433 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YIL059C	P40520	121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	CUP9	P41817	306 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	DSK2	P48510	373 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	ODC2	Q99297	307 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	UBR1	P19812	1950 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YMD8	YML038C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	FIT1	Q04433	528 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	FYV12	Q08559	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	TIM9	O74700	87 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YCR050C	P25630	102 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YND1	P40009	630 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YER135C	P40082	130 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YIR035C	P40579	254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	DOC1	P53068	250 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	SAY1	P53324	424 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YNR064C	P53750	290 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RAD28	Q12021	506 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	ATO3	Q12359	275 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	MED11	Q99278	115 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	MSW1	P04803	379 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL43B	P0CX26	92 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	SRB6	P32570	121 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YIL152W	P40455	235 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YDR274C	P87283	123 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YLR281C	Q05863	155 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	IRC25	Q07951	179 aa		4	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	SCM4	P32564	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	UMP1	P38293	148 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPS27B	P38711	82 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	IPT1	P38954	527 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	PEP8	P40335	379 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	HFA1	P32874	2273 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	TIR3	P40552	269 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	MET31	Q03081	177 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YMD8	YML038C	LIP1	Q03579	150 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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