RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	RAD6	P06104	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	PAI3	P01094	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	AVT7	P40501	490 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YFL065C	P43539	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YGR050C	P53231	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	FIT3	Q08907	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	HFA1	P32874	2273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	RSM10	Q03201	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	HEM4	P06174	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MRS4	P23500	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	UMP1	P38293	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YJL213W	P40896	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YGL034C	P53186	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	NRM1	P53718	249 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YNL234W	P53857	426 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ANT1	Q06497	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SYM1	Q06563	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	IRC19	Q07843	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	BLM10	P43583	2143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	VMA11	P32842	164 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YGL088W	P53151	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	RCE1	Q03530	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SPS100	P13130	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	LDB16	P25587	256 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MIG1	P27705	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	EST3	Q03096	181 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MSW1	P04803	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PAM17	P36147	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	CWP2	P43497	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PGU1	P47180	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PCP1	P53259	346 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	RRT7	Q07829	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	CDC43	P18898	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	TRS23	Q03784	219 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	IRC22	P40006	225 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	GAT4	P40569	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	TIM18	Q08749	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	IRA1	P18963	3092 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PET8	P38921	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	MDH2	P22133	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YGL010W	P25338	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PHS1	P40857	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	ECM12	O13529	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	MRPL39	P36533	70 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YIL169C	P40442	995 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	FIT1	Q04433	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	FLO9	P39712	1322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	DFG10	P40526	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	REE1	P40893	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YGR018C	P53211	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	MIX14	Q04341	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	COA6	Q3E846	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	TRP1	P00912	224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	AHT1	P29589	182 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	SFT2	P38166	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YND1	P40009	630 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YGR164W	P53291	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	PRM3	Q08931	133 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	TDA4	P47153	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	NAT5	Q08689	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	SWM2	P40342	146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	RAF1	Q06891	181 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	CYB5	P40312	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GPT2	YKR067W	YKR073C	P36153	106 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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