RNA–Protein interactions for RNA: YKR029C

SET3, Transcript of Defining member of the SET3 histone deacetylase complex, yeast

Gene SET3, Length 2,256 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET3	YKR029C	YPR114W	Q06107	315 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	NKP2	Q06162	153 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	ATG41	Q12048	136 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	FES1	P38260	290 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YEL067C	P39978	195 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YGL235W	P53071	178 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	TIM8	P57744	87 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YML079W	Q03629	201 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	UPS1	Q05776	175 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	STT4	P37297	1900 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	MRPL15	P36523	253 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CYC2	P38909	366 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YEL073C	P39974	107 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PAC10	P48363	199 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SOL1	P50278	321 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	THI74	Q04083	370 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	MIX14	Q04341	121 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SYM1	Q06563	197 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	UIP4	Q08926	304 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.57	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	UBC8	P28263	218 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	AHT1	P29589	182 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PTC1	P35182	281 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS27B	P38711	82 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YEL008W	P40001	126 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YGL101W	P53144	215 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	HSK3	P69852	69 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	LIP1	Q03579	150 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RIM9	Q04734	239 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YDL157C	Q12082	118 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RDI1	Q12434	202 aa		0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CPR5	P35176	225 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YEL028W	P39989	153 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YER121W	P40076	114 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	MPM1	P40364	252 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SWC7	Q06707	132 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SPS2	P08459	502 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	AQY2	P0CD90	149 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	ETR1	P38071	380 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YBR242W	P38331	238 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YGR269W	P40326	108 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	ELP6	Q04868	273 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	OCA6	Q12454	224 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.55	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	ATP5	P09457	212 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CSH1	P38287	376 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	AME1	P38313	324 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YFL051C	P43552	160 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	FIT1	Q04433	528 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YPD1	Q07688	167 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	NSL1	Q12143	216 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	DER1	P38307	211 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	DLS1	P40366	167 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	GEP7	P53171	287 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YNR064C	P53750	290 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	LDB18	Q07887	179 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	HUA1	P40325	198 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	APQ12	P40532	138 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	CIN5	P40917	295 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RTR2	Q12378	196 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	BPH1	P25356	2167 aa		0.53	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	FIG1	P38224	298 aa		0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	YIL102C	P40488	101 aa		0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	DCV1	P43595	202 aa		0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	APS3	P47064	194 aa		0.53	□□□□□ -2.33
SET3	YKR029C	CCC1	P47818	322 aa		0.53	□□□□□ -2.33

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