RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443037.1

SOX9-AS1-206, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOX9-AS1, Length 394 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-206ENST00000443037 AP3M2P53677 418 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PKP1Q13835 747 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PSMD6Q15008 389 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HPS3Q969F9 1004 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HPDLQ96IR7 371 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FNBP1Q96RU3 617 aa15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TACC1O75410 805 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 F11P03951 625 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CLDN10P78369 228 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KRT85P78386 507 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CYP24A1Q07973 514 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BFSP1Q12934 665 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GRM2Q14416 872 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GPR158Q5T848 1215 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 VSTM1Q6UX27 236 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 YAF2Q8IY57 180 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NELL1Q92832 810 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CDH9Q9ULB4 789 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MYH10P35580 1976 aa15.01□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LAMTOR5O43504 91 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SOAT2O75908 522 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NOL4O94818 638 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PFKLP17858 780 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TNNI1P19237 187 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 WARSP23381 471 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ATICP31939 592 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NLRP12P59046 1061 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CUL4BQ13620 913 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TMEM150AQ86TG1 271 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CMTM8Q8IZV2 173 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FAM3CQ92520 227 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PAGE5Q96GU1 130 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CGRRF1Q99675 332 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LPIN3Q9BQK8 851 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC46A2Q9BY10 475 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADAM33Q9BZ11 813 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CHRDQ9H2X0 955 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 VRTNQ9H8Y1 702 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIF9Q9HAQ2 790 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SLC39A2Q9NP94 309 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TMLHEQ9NVH6 421 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EHD2Q9NZN4 543 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HPSEQ9Y251 543 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PTPRJQ12913 1337 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PDXKO00764 312 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KLRC4O43908 158 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIF20AO95235 890 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CD72P21854 359 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 AFMP43652 599 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PPP2R5DQ14738 602 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MON1AQ86VX9 555 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPATA17Q96L03 361 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPATA32Q96LK8 384 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DMAC2Q9NW81 257 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.99□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.98□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.98□□□□□ -0.01
SOX9-AS1-206ENST00000443037 A0A1W2PQ27 194 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms