RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ASB2Q96Q27 587 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 HMGXB4Q9UGU5 601 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 YIPF1Q9Y548 306 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ASB3Q9Y575 518 aa28.48■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 LGALS16A8MUM7 142 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 CCL16O15467 120 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SLC34A2O95436 690 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 KCNMA1Q12791 1236 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 VSTM1Q6UX27 236 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 UBR7Q8N806 425 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ATP8B3O60423 1300 aa28.47■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN2P17706 415 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 CYP2F1P24903 491 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 CDR1P51861 262 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 UBXN1Q04323 297 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF394Q53GI3 561 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 TTC9BQ8N6N2 239 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 TWNKQ96RR1 684 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 LPIN3Q9BQK8 851 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 B3GNT5Q9BYG0 378 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.46■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 BDNFP23560 247 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 RAD23BP54727 409 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 IQCEQ6IPM2 695 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A11Q8NBS3 891 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 KAT5Q92993 513 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 MED10Q9BTT4 135 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SIX2Q9NPC8 291 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1257Q9ULG3 409 aa28.45■■■□□ 2.15
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINC1P01008 464 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ACO1P21399 889 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ORC1Q13415 861 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 VEPH1Q14D04 833 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC142Q17RM4 750 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM270Q6UE05 265 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ITIH5Q86UX2 942 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CYFIP2Q96F07 1278 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CEP295NLQ96MC4 621 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 KREMEN1Q96MU8 473 aa28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PAEPP09466 180 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 RFX1P22670 979 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 KCNQ1P51787 676 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf29Q8N999 325 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CEP72Q9P209 647 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CNTN6Q9UQ52 1028 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 NOTCH4Q99466 2003 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM66O15016 1216 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SOAT2O75908 522 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 GRIK1P39086 918 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 GJB7Q6PEY0 223 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SCN4BQ8IWT1 228 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa28.43■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 GREB1Q4ZG55 1949 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN5O00501 218 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 BMP1P13497 986 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 APBA1Q02410 837 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DDR2Q16832 855 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 FUKQ8N0W3 1084 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 LEMD2Q8NC56 503 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SLC2A14Q8TDB8 520 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 PSMG2Q969U7 264 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCD1Q96GM5 515 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf48Q96LL4 319 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 FAM49BQ9NUQ9 324 aa28.42■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 VDRP11473 427 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ATF6P18850 670 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ANXA13P27216 316 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 FANCCQ00597 558 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 TAF12Q16514 161 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 CYP4A22Q5TCH4 519 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 FAM35AQ86V20 835 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.41■■■□□ 2.14
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA17Q96L03 361 aa28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms