RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 MTAPQ13126 283 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PKP1Q13835 747 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PPP2R5DQ14738 602 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM84AQ96KN4 292 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FNBP1Q96RU3 617 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 USP25Q9UHP3 1055 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 KLRC4O43908 158 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CCNE1P24864 410 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CYP2F1P24903 491 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CTHP32929 405 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 AVPR1AP37288 418 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NRLP54845 237 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PSMD2Q13200 908 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CUL4BQ13620 913 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 LRRC32Q14392 662 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 VSTM1Q6UX27 236 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MON1AQ86VX9 555 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPATA17Q96L03 361 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SYT15Q9BQS2 421 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 EPC1Q9H2F5 836 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MYH10P35580 1976 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FRYLO94915 3013 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP250Q9BV73 2442 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CLIC2O15247 247 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TADA3O75528 432 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TCF3P15923 654 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 PFKLP17858 780 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TNNI1P19237 187 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CMA1P23946 247 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ATICP31939 592 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GPR15P49685 360 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 AP3M2P53677 418 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CLDN10P78369 228 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 DDR2Q16832 855 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 RUBCNQ92622 972 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 TDP1Q9NUW8 608 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 CACNA1AO00555 2505 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.52□□□□□ -0.08
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 LMO2P25791 158 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CASP1P29466 404 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 AFMP43652 599 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CYP2J2P51589 502 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CCINQ13939 588 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RDH13Q8NBN7 331 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 DMAC2Q9NW81 257 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 EHD2Q9NZN4 543 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HPSEQ9Y251 543 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 TRIM66O15016 1216 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 HCRTO43612 131 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C6-201ENST00000329970 PFKFB1P16118 471 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms