RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W GZF3P42944 551 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RAV2Q03956 351 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W DPP1Q05521 289 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W DAP1Q12091 152 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W WIP1Q2V2P8 89 aa8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W BLM10P43583 2143 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W POL2P21951 2222 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W CYC3P06182 269 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W MTC6P38849 526 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YGR017WP53210 297 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W MRX11Q03079 207 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YML079WQ03629 201 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ATG33Q06485 197 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YOS1Q3E834 85 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W Q0144Q9ZZW2 109 aa8.55□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YPT10P38146 199 aa8.54□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W BDH1P39714 382 aa8.54□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W GON7P46984 123 aa8.54□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YDL129WQ07555 291 aa8.54□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YPL257WQ08974 193 aa8.54□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W PAI3P01094 68 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W MRS1P07266 363 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W RPL12BP0CX54 165 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W NOP1P15646 327 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W NUD1P32336 851 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W POP3P53833 195 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W ATG4P53867 494 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W BET5Q03630 159 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W YDR215CQ12240 137 aa8.53□□□□□ -1.04
PRP4YPR178W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W CPR1P14832 162 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W PAU7P39545 55 aa8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W VPS71Q03433 280 aa8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W NUP53Q03790 475 aa8.52□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W MDM10P18409 493 aa8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W FZF1P32805 299 aa8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W CSH1P38287 376 aa8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W TOM7P53507 60 aa8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W HTL1Q9URQ5 78 aa8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W BRR2P32639 2163 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W CAB4P53332 305 aa8.5□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W API2Q04413 109 aa8.5□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W ATP10P18496 279 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W ARO2P28777 376 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YGP1P38616 354 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W DOG2P38773 246 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W HUA1P40325 198 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YJL118WP47022 219 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YDR209CQ03480 137 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W ATG39Q06159 398 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W TIM18Q08749 192 aa8.49□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W SFT2P38166 215 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YBL071CP38185 102 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YHL044WP38727 235 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YFR045WP43617 309 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W SIP18P50263 79 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YPS1P32329 569 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YIL012WP40551 113 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YPI1P43587 155 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YGR018CP53211 109 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YDR114CQ04597 100 aa8.48□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YCR022CP25620 114 aa8.47□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W YDL218WQ07629 317 aa8.47□□□□□ -1.05
PRP4YPR178W UTH1P36135 365 aa8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W LSM2P38203 95 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YNL198CP40166 100 aa8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W NRM1P53718 249 aa8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W SDH7Q04401 133 aa8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W SLO1Q3E784 85 aa8.46□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa8.45□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W YKL044WP36092 106 aa8.44□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W ECM33P38248 429 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W CRZ1P53968 678 aa8.44□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W IRC25Q07951 179 aa8.44□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W RNH203Q12338 110 aa8.44□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W DAL82P21705 255 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W APS1P35181 156 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W PIR5P46999 287 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W HST4P53688 370 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W DAD4P69851 72 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W GTO3Q04806 366 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W AYT1Q12226 474 aa8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W HEM4P06174 275 aa8.42□□□□□ -1.06
PRP4YPR178W SOR1P35497 357 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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