RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SOR2	Q07786	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	NAT5	Q08689	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	HAP3	P13434	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YOX1	P34161	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	AME1	P38313	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	DOG1	P38774	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MTC6	P38849	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	UBC13	P52490	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	NRM1	P53718	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	LPP1	Q04396	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	ECM18	Q04623	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	TVP18	Q04767	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	CNL1	Q06333	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RAF1	Q06891	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PAU23	Q07987	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PAU17	Q12370	124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	HFA1	P32874	2273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	STF1	P01098	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PMU1	P36069	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YAR068W	P39564	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YIL163C	P40448	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YNR064C	P53750	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	ATP19	P81451	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	NUP53	Q03790	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	GEP5	Q12393	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	MRS3	P10566	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	TIR1	P10863	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YHR173C	P38864	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YER134C	P40081	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	NDE2	Q07500	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	UTR5	P32630	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PAM17	P36147	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	TEM1	P38987	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	GON7	P46984	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YJL028W	P47062	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SIP18	P50263	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	CWC27	Q02770	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSH1	YOL054W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	CUP2	P15315	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	DAL82	P21705	255 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YCR041W	P37265	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YJL118W	P47022	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YGL118C	P53132	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	GIM5	Q04493	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	RFM1	Q12192	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	MIG1	P27705	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YBR090C	P38253	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	CSH1	P38287	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	MRX11	Q03079	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YHP1	Q04116	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	CYC3	P06182	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	ZRT1	P32804	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	HAC1	P41546	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	TDA4	P47153	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YGL230C	P53074	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	SNA4	Q07549	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	FIT2	Q08906	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	CSM4	Q08955	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	BDH1	P39714	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	BRP1	P53194	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	YDR366C	P87287	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	RAV2	Q03956	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	CSI2	Q08054	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSH1	YOL054W	MRS1	P07266	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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