RNA–Protein interactions for RNA: YMR037C

MSN2, Transcript of Stress-responsive transcriptional activator, yeast

Gene MSN2, Length 2,115 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSN2	YMR037C	YAL064W	P39711	94 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YEL073C	P39974	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	FLX1	P40464	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	RRT1	P38192	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	MIG3	P39943	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	TIR3	P40552	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	FEX1	Q08913	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	FEX2	Q08991	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	RRT13	P40042	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	SHH3	Q04487	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	CSI2	Q08054	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	PDR10	P51533	1564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YGL010W	P25338	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	ECO1	P43605	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	RAD10	P06838	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YET1	P35723	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	MRPL44	P19956	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	REE1	P40893	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YFR035C	P43608	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	RIM9	Q04734	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	FIT3	Q08907	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	ATP19	P81451	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MSN2	YMR037C	LYS2	P07702	1392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	COX5B	P00425	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YHL042W	P38729	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	ERG25	P53045	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	SRL1	Q08673	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YBL059W	P34224	193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	TVP23	P38962	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YNL217W	P40152	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	GRX5	Q02784	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	ERV14	P53173	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YGR026W	P53217	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	MPC3	P53311	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	UBC4	P15731	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	TDA2	P40045	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	FLO11	P08640	1367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	FMT1	P32785	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	SWD3	P38123	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YPL067C	Q02754	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	ECM34	P38728	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	SNF11	P38956	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YKL044W	P36092	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	SPO73	P40031	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	GPI11	Q06636	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	RAF1	Q06891	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	COA6	Q3E846	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YCR043C	P25361	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	KNH1	P50112	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	MAK31	P23059	88 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YHP1	Q04116	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	PIN3	Q06449	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	COA4	Q05809	96 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSN2	YMR037C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	ECM12	O13529	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	FZF1	P32805	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	HPA3	P39979	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	PIR5	P46999	287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	QCR10	P37299	77 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	COX4	P04037	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	GPI19	Q04082	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	SOM1	Q05676	74 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	ASK1	P35734	292 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	EMC5	P40540	141 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	IRC23	Q08416	157 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	PPT2	Q12036	173 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MSN2	YMR037C	ATG40	Q99325	256 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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