RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	SYM1	Q06563	197 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LDS2	Q08218	356 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	TIR2	P33890	251 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GOS1	P38736	223 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	DOG2	P38773	246 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	DOG1	P38774	246 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YMR141C	P40211	102 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YPS5	P53057	165 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGL088W	P53151	121 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	LST7	P53237	242 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YIP3	P53633	176 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	UBC7	Q02159	165 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	GRX3	Q03835	250 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	RRT7	Q07829	113 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.78	□□□□□ -2.28
TTI1	YKL033W	VAR1	P02381	398 aa		0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SYS1	P41544	203 aa		0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	CTR3	Q06686	241 aa		0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	UBA3	Q99344	299 aa		0.78	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	Q0255	P03881	472 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	AHC2	P25649	128 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	IRC22	P40006	225 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PGD1	P40356	397 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SNL1	P40548	159 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YCH1	P42937	148 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YGL185C	P53100	379 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MMS2	P53152	137 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YKL070W	P36087	169 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SMP1	P38128	452 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YBR090C	P38253	122 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	BNS1	P50084	137 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	KEI1	Q06346	221 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	GPN3	Q06543	272 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RDI1	Q12434	202 aa		0.77	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SEC22	P22214	214 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YBL071C	P38185	102 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SNF11	P38956	169 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	FMP33	P46998	180 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DSK2	P48510	373 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YGR017W	P53210	297 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	THI74	Q04083	370 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MED4	Q12343	284 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	CDC50	P25656	391 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MRPL3	P36516	390 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RRT13	P40042	185 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YER085C	P40058	173 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YNL217W	P40152	326 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YJL028W	P47062	111 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	AIM24	P47127	394 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SRB7	P47822	140 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YGL149W	P53116	101 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PAM18	Q07914	168 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PRR2	Q12310	699 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	COA2	Q3E823	68 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PET20	Q99373	253 aa		0.76	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SPO13	P23624	291 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	CSH1	P38287	376 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	BRP1	P53194	125 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YMR007W	Q03675	126 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DCS1	Q06151	350 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MSH5	Q12175	901 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	MRP49	P32388	137 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DER1	P38307	211 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HCH1	P53834	153 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	DIA1	P54005	336 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	SPO19	Q03029	223 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	YPL264C	Q08980	353 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	HTB2	P02294	131 aa		0.75	□□□□□ -2.29
TTI1	YKL033W	PUT1	P09368	476 aa		0.75	□□□□□ -2.29

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