RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	CPT1	P17898	393 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	MDH2	P22133	377 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	CPR2	P23285	205 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YCR085W	P25650	117 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	ANS1	P38832	159 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YAR068W	P39564	161 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YNL194C	P40169	301 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YIP5	P53108	310 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YGR039W	P53225	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	TPC1	P53257	314 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	YNL234W	P53857	426 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	VPS71	Q03433	280 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	RRG8	Q06109	277 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	BOL1	Q3E793	110 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	ENV10	Q99382	181 aa		2.84	□□□□□ -1.95
ECO1	YFR027W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RPB8	P20436	146 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	AHT1	P29589	182 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	GLE2	P40066	365 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CYB5	P40312	120 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	TIS11	P47977	285 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	BXI1	P48558	297 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CAX4	P53223	239 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	WSC2	P53832	503 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SLG1	P54867	378 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	COX12	Q01519	83 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	FCY1	Q12178	158 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YDL180W	Q12301	547 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MSB2	P32334	1306 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	ECM29	P38737	1868 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	OPI3	P05375	206 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CDC21	P06785	304 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	QCR9	P22289	66 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	ECM15	P35195	104 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YKL044W	P36092	106 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SAS2	P40963	338 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	CWP2	P43497	92 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YGR164W	P53291	111 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YNL143C	P53908	130 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	LPP1	Q04396	274 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YMR317W	Q04893	1140 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	NAT3	Q06504	195 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	HPA2	Q06592	156 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	FIT3	Q08907	204 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YDR029W	Q12111	104 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RFM1	Q12192	310 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	FLO9	P39712	1322 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YRF1-6	P53819	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YMR31	P19955	123 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MRS4	P23500	304 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SPO13	P23624	291 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	AGA2	P32781	87 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	TOM6	P33448	61 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
ECO1	YFR027W	MID2	P36027	376 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	NRG2	P38082	220 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	IML3	P38265	245 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	EGT2	P42835	1041 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YFR057W	P43625	151 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	LCB3	P47013	409 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	BUD25	P85052	153 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SDC1	Q03323	175 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.81	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	YCR025C	P25352	136 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	MRPS5	P33759	307 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	VID24	P38263	362 aa		2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
ECO1	YFR027W	SNF11	P38956	169 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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