RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 ITIH5Q86UX2 942 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HSCBQ8IWL3 235 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DRC1Q96MC2 740 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TASP1Q9H6P5 420 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 IL21Q9HBE4 155 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 EBF1Q9UH73 591 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DNM3Q9UQ16 869 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TCHHQ07283 1943 aa8.3□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SCN1AP35498 2009 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC169A6NNP5 214 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HIP1RO75146 1068 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 OR4Q2P0C623 313 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SYT1P21579 422 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CDC25CP30307 473 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TNK2Q07912 1038 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RESTQ13127 1097 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RUNX3Q13761 415 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC6Q16204 474 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 FBXO43Q4G163 708 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 GPR158Q5T848 1215 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RNF43Q68DV7 783 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATL3Q6DD88 541 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SYT13Q7L8C5 426 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TTC13Q8NBP0 860 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TCHPQ9BT92 498 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HPS4Q9NQG7 708 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TBX20Q9UMR3 447 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 THADAQ6YHU6 1953 aa8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 E9PMD0 336 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 H0YCG3 227 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CLDN3O15551 220 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 STX6O43752 255 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 FAM189A1O60320 539 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 RHOBTB1O94844 696 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CLTAP09496 248 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C1QTNF9P0C862 333 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC192P0DO97 292 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CXCL8P10145 99 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CEACAM1P13688 526 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ATF6P18850 670 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 DRD1P21728 446 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CDC25AP30304 524 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 LILRA4P59901 499 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 AMPD2Q01433 879 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SMARCB1Q12824 385 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 STRN3Q13033 797 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 IL17AQ16552 155 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 KYAT1Q16773 422 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 SPATA1Q5VX52 437 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 USP37Q86T82 979 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 C11orf74Q86VG3 221 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.28□□□□□ -1.08
RBBP4-211ENST00000477563 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms