RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474272.1

TMEM50B-208, Transcript of transmembrane protein 50B, human

TSL 3

Gene TMEM50B, Length 518 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM50B-208	ENST00000474272	TLE1	Q04724	770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	MIER2	Q8N344	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMEM50B-208	ENST00000474272	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272		E7ENX8	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	VCAM1	P19320	739 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PCSK6	P29122	969 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TUBA4A	P68366	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TAP2	Q03519	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TISP43	B9A030	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	F2RL2	O00254	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	POU2F2	P09086	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PDC	P20941	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	AKAP5	P24588	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PTGER1	P34995	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TBX4	P57082	545 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	RAB39A	Q14964	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	REPS1	Q96D71	796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ZNF213	O14771	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PPM1D	O15297	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	AP1G1	O43747	822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SGTA	O43765	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	OFD1	O75665	1012 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	KIF20A	O95235	890 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	GJB1	P08034	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NDUFB7	P17568	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	MAL	P21145	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	USP45	Q70EL2	814 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TRIM38	O00635	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	PPP6C	O00743	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	MOSPD3	O75425	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	HSPA6	P17066	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SP2	Q02086	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	FHL1	Q13642	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TMEM50B-208	ENST00000474272	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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