RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 MRIQ9BWK5 157 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SNX3O60493 162 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 CBX6O95503 412 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 TTC4O95801 387 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GH1P01241 217 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 CYP2C9P11712 490 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 AP3M2P53677 418 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PRELID2Q8N945 189 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 COL20A1Q9P218 1284 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ASAP2O43150 1006 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ATP9BO43861 1147 aa16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 MAP7Q14244 749 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 TTC25Q96NG3 672 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 MYH8P13535 1937 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GMNNO75496 209 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 MUTP22033 750 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SNAPC2Q13487 334 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ANO5Q75V66 913 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PGM2Q96G03 612 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 TLK1Q9UKI8 766 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 M0R2N6 131 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PIK3CDO00329 1044 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 TMC2Q8TDI7 906 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.09■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GHRP10912 638 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 FNTAP49354 379 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 BTNL9Q6UXG8 535 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.08■□□□□ 0.17
FGD1-201ENST00000375135 A8MUI8 341 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 INSRRP14616 1297 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 RCN1Q15293 331 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 CNGA2Q16280 664 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 THTPAQ9BU02 230 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 PFDN1O60925 122 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 PRPSAP1Q14558 356 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 RPS6KA2Q15349 733 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 EXT2Q93063 718 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 MTFR1LQ9H019 292 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 HEY2Q9UBP5 337 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 POLIQ9UNA4 740 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 B2RBV5 119 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 BNIP3LO60238 219 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 SLC25A27O95847 323 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 ZCCHC18P0CG32 403 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 TGFB2P61812 414 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 DCAF6Q58WW2 860 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.08■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.07■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 PPFIA2O75334 1257 aa16.07■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 CCNE2O96020 404 aa16.07■□□□□ 0.16
FGD1-201ENST00000375135 CREB1P16220 341 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms