RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olig1Q9JKN5 260 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plch1Q4KWH5 1682 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc35g2D3YVE8 412 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Heatr4E9Q357 955 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc10bG3XA50 292 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ift81O35594 676 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mdm4O35618 489 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 E2f6O54917 272 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rgs9bpQ148R9 237 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Phactr1Q2M3X8 580 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfyve27Q3TXX3 415 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 NostrinQ6WKZ7 506 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ttc24Q8BYG0 334 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Taf2Q8C176 1104 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cpa5Q8R4H4 436 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Grin3bQ91ZU9 1003 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cog2Q921L5 731 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wdr64Q9D565 1086 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 FignQ9ERZ6 759 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cpb2Q9JHH6 422 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dmap1Q9JI44 468 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdcd7Q9WTY1 482 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Myh4Q5SX39 1939 aa7.36□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Taf1Q80UV9 1891 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm8113E0CXS8 587 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 PbsnO08976 174 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Per1O35973 1291 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rhox6O70238 227 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cxcl9P18340 126 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cct8P42932 548 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cav1P49817 178 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc26a1P58735 704 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 SPINDOCQ05AH6 381 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tatdn3Q3U1C6 294 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nr1d1Q3UV55 615 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmtc1Q3UV71 942 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 PapolaQ61183 739 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Myo6Q64331 1265 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 RbakQ8BQC8 711 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zmym6Q8BS54 1249 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 E330017A01RikQ8BU47 192 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Brat1Q8C3R1 822 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ano4Q8C5H1 955 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Uba6Q8C7R4 1053 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc8cQ8R502 803 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Erap1Q9EQH2 930 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trpc4Q9QUQ5 974 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 RpgrQ9R0X5 1001 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cd97Q9Z0M6 818 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atxn10P28658 475 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 B3gat3P58158 335 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Npas2P97460 816 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Samd11Q1RNF8 542 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kpna1Q60960 538 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tas2r115Q7M719 310 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trnp1Q80ZI1 223 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc40Q8BI79 1192 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Thap3Q8BJ25 218 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ttc39bQ8BYY4 617 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 VcpkmtQ8C436 228 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 GanQ8CA72 597 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dqx1Q924H9 718 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Foxp3Q99JB6 429 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 MymkQ9D1N4 221 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mss51Q9D5Z5 446 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Homer2Q9QWW1 354 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Etnk2A7MCT6 385 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hoxa11P31311 313 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stmn2P55821 179 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Drp2Q05AA6 957 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pfdn4Q3UWL8 134 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Afg1lQ3V384 480 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Phlda1Q62392 405 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam167aQ6P1G6 215 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Armc6Q8BNU0 468 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 DpydQ8CHR6 1025 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vps39Q8R5L3 886 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 TraipQ8VIG6 470 aa7.35□□□□□ -1.23
Trps1-201ENSMUST00000077935 Chn1Q91V57 459 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 64.7 ms