Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Nr1d1Q3UV55 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nr1d1Q3UV55 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Nr1d1Q3UV55 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Nr1d1Q3UV55 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nr1d1Q3UV55 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nr1d1Q3UV55 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Nr1d1Q3UV55 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nr1d1Q3UV55 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Nr1d1Q3UV55 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nr1d1Q3UV55 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Nr1d1Q3UV55 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nr1d1Q3UV55 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Nr1d1Q3UV55 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nr1d1Q3UV55 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nr1d1Q3UV55 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nr1d1Q3UV55 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nr1d1Q3UV55 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nr1d1Q3UV55 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nr1d1Q3UV55 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nr1d1Q3UV55 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nr1d1Q3UV55 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Nr1d1Q3UV55 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Nr1d1Q3UV55 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nr1d1Q3UV55 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nr1d1Q3UV55 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nr1d1Q3UV55 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nr1d1Q3UV55 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nr1d1Q3UV55 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nr1d1Q3UV55 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Nr1d1Q3UV55 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nr1d1Q3UV55 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nr1d1Q3UV55 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nr1d1Q3UV55 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nr1d1Q3UV55 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nr1d1Q3UV55 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nr1d1Q3UV55 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Nr1d1Q3UV55 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nr1d1Q3UV55 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Nr1d1Q3UV55 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nr1d1Q3UV55 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Nr1d1Q3UV55 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nr1d1Q3UV55 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nr1d1Q3UV55 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nr1d1Q3UV55 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nr1d1Q3UV55 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Nr1d1Q3UV55 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nr1d1Q3UV55 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nr1d1Q3UV55 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nr1d1Q3UV55 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nr1d1Q3UV55 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nr1d1Q3UV55 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nr1d1Q3UV55 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nr1d1Q3UV55 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nr1d1Q3UV55 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nr1d1Q3UV55 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nr1d1Q3UV55 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nr1d1Q3UV55 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nr1d1Q3UV55 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nr1d1Q3UV55 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nr1d1Q3UV55 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nr1d1Q3UV55 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nr1d1Q3UV55 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nr1d1Q3UV55 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nr1d1Q3UV55 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nr1d1Q3UV55 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nr1d1Q3UV55 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nr1d1Q3UV55 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nr1d1Q3UV55 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nr1d1Q3UV55 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nr1d1Q3UV55 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nr1d1Q3UV55 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nr1d1Q3UV55 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nr1d1Q3UV55 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nr1d1Q3UV55 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nr1d1Q3UV55 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nr1d1Q3UV55 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nr1d1Q3UV55 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nr1d1Q3UV55 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nr1d1Q3UV55 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nr1d1Q3UV55 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nr1d1Q3UV55 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nr1d1Q3UV55 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nr1d1Q3UV55 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nr1d1Q3UV55 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nr1d1Q3UV55 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Nr1d1Q3UV55 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nr1d1Q3UV55 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nr1d1Q3UV55 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nr1d1Q3UV55 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nr1d1Q3UV55 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nr1d1Q3UV55 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nr1d1Q3UV55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nr1d1Q3UV55 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nr1d1Q3UV55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nr1d1Q3UV55 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nr1d1Q3UV55 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nr1d1Q3UV55 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms