RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	CDS1	P38221	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YPC1	P38298	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	TDA4	P47153	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	MIC26	P50087	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YGL117W	P53133	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	CAF40	P53829	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	FYV6	P53913	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	DYN2	Q02647	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	CYC3	P06182	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	CPR4	P25334	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	RRT1	P38192	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	LAG1	P38703	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	POR2	P40478	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YIL024C	P40543	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DRE2	YKR071C	YBL071C	P38185	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	NIF3	P53081	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	EST3	Q03096	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	DCS1	Q06151	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	PAM18	Q07914	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	TIM18	Q08749	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
DRE2	YKR071C	YFR035C	P43608	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SNN1	P48232	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	GLO1	P50107	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YGR050C	P53231	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
DRE2	YKR071C	OCA2	P53949	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	LDS1	P31379	325 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SRB6	P32570	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	HOT13	P36078	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	ERV15	P38312	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	HHO1	P53551	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YKL162C	P36052	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	WSS1	P38838	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	MCM22	P47167	239 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	QCR2	P07257	368 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	ECM25	P32525	599 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SDH8	P38345	138 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SRB7	P47822	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	DXO1	Q06349	442 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	RRT7	Q07829	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	LDS2	Q08218	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	ISN1	Q99312	450 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	ZRC1	P20107	442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	POP5	P28005	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	UPS2	P35200	230 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SNF11	P38956	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YIR035C	P40579	254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	RTS2	P40962	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	YGR018C	P53211	109 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SNO1	Q03144	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
DRE2	YKR071C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	CMC1	P36064	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	AVT5	P38176	459 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	EMC5	P40540	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YGR026W	P53217	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	HAL1	Q01766	294 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	VPS28	Q02767	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YCT1	Q12235	531 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	PRM7	Q12459	698 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YCR022C	P25620	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	MSK1	P32048	576 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	SIP1	P32578	815 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	HXT14	P42833	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YGR025W	P53216	100 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	ARR3	Q06598	404 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	FCY2	P17064	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	BDH1	P39714	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YEA6	P39953	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	PGD1	P40356	397 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	POG1	P40473	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YPS3	Q12303	508 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	CDC7	P06243	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.3 ms