RNA–Protein interactions for RNA: YDL208W

NHP2, Transcript of Protein related to mammalian high mobility group (HMG) proteins, yeastyeast

Gene NHP2, Length 471 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NHP2YDL208W SNX4P47057 423 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W TAD2P47058 250 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SIP18P50263 79 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W LST7P53237 242 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RSM27P53305 110 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W HCH1P53834 153 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W NRK1P53915 240 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SED1Q01589 338 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YDC1Q02896 317 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YDR286CQ05530 114 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YPR098CQ06089 161 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YLR031WQ07978 186 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YNG1Q08465 219 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YOR186WQ08560 144 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FIT3Q08907 204 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W USB1Q12208 290 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YCT1Q12235 531 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PRR2Q12310 699 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W TIM22Q12328 207 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RTR2Q12378 196 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RDI1Q12434 202 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ERP4Q12450 207 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W BOL1Q3E793 110 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W VMA9Q3E7B6 73 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YHR213W-AQ8TGT4 77 aa0.63□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W TDH1P00360 332 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W REP2P03872 296 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RPL39P04650 51 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RPL43BP0CX26 92 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SPS100P13130 326 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SAR1P20606 190 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ROX3P25046 220 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YCR101CP25607 182 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W AHT1P29589 182 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MSK1P32048 576 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YUH1P35127 236 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MCH2P36032 473 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YKL162CP36052 402 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ADH5P38113 351 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SLM6P38343 150 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CUE1P38428 203 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CTR2P38865 189 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W IKI1P38874 309 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SPC25P40014 221 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YGR269WP40326 108 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YIL012WP40551 113 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PIR5P46999 287 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YJR012CP47087 207 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ARP3P47117 449 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W XPT1P47165 209 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SOL1P50278 321 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PNC1P53184 216 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YGR050CP53231 118 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MRPL50P53724 139 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FMP41P53889 259 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YNL046WP53956 172 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W HSK3P69852 69 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W VPS28Q02767 242 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YPL077CQ02831 240 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YML018CQ03730 393 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YDR248CQ03786 193 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CAB5Q03941 241 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W PLP1Q04004 230 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FIT1Q04433 528 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YMR253CQ04835 414 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W UPS1Q05776 175 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W FRQ1Q06389 190 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W CTR3Q06686 241 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W BER1Q06688 274 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RRT7Q07829 113 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SCP1Q08873 200 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W MED4Q12343 284 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YLR118CQ12354 227 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ATG5Q12380 294 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W DGK1Q12382 290 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ATG31Q12421 196 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YHR086W-AQ3E746 53 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W Q0297Q9ZZV8 51 aa0.62□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W APA2P22108 325 aa0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SRP21P32342 167 aa0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YBL010CP32788 280 aa0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W VMA11P32842 164 aa0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W ECM31P38122 312 aa0.61□□□□□ -2.31
NHP2YDL208W YBR013CP38215 129 aa0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms