RNA–Protein interactions for RNA: YDL084W

SUB2, Transcript of Component of the TREX complex required for nuclear mRNA export, yeast

Gene SUB2, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUB2	YDL084W	IES4	Q08561	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	KRE1	P17260	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	CDC43	P18898	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SPO13	P23624	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YGL010W	P25338	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	URA10	P30402	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	CDC5	P32562	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SDS24	P38314	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	CUP9	P41817	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	RNH201	P53942	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ANT1	Q06497	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	TRP1	P00912	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	TFS1	P14306	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PAU3	P25610	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YCR085W	P25650	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YMC2	P38087	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PHO89	P38361	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	IRC22	P40006	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	EMC4	P53073	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MST27	P53176	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MIX23	P38162	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YAR029W	P39549	74 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YNL198C	P40166	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YIL165C	P40446	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YJL213W	P40896	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	TDA4	P47153	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SLG1	P54867	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ROT1	Q03691	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ARR3	Q06598	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	HRT1	Q08273	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SWM1	Q12379	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PAM17	P36147	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SFT2	P38166	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MBB1	P39534	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	TOS8	P53147	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ADD37	Q03233	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	JID1	Q12350	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	HEM2	P05373	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	MID2	P36027	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	PEX17	P40155	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	BUD25	P85052	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	SPR6	Q01684	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	ENV10	Q99382	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SUB2	YDL084W	IML1	P47170	1584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	APS1	P35181	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	FIP1	P45976	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	NCE103	P53615	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PET191	Q02772	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	TIM18	Q08749	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	NRG2	P38082	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SPO73	P40031	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	PHS1	P40857	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MCH4	Q08268	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YCR050C	P25630	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	SHE1	P38200	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	CSH1	P38287	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	CTF8	P38877	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YER134C	P40081	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	YER181C	P40097	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	MPM1	P40364	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB2	YDL084W	GAT4	P40569	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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