RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PANK4Q9NVE7 773 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCLQ9NW38 375 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF20AO95235 890 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNB1P11230 501 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC3P17980 439 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 LMNB2Q03252 620 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TWF1Q12792 350 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 STK4Q13043 487 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf186Q6ZWK4 172 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DYMQ7RTS9 669 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM3CQ92520 227 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF7Q92985 503 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CRISPLD1Q9H336 500 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PIAS3Q9Y6X2 628 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 BICDL2A1A5D9 508 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP8P85298 464 aa26.04■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 SEZ6Q53EL9 994 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SHKBP1Q8TBC3 707 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 IER2Q9BTL4 223 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TIPINQ9BVW5 301 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NUB1Q9Y5A7 615 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 IDEP14735 1019 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 GAP43P17677 238 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHBP21912 280 aa26.03■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY2CP25092 1073 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SATB1Q01826 763 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TEAD2Q15562 447 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4A22Q5TCH4 519 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF280DQ6N043 979 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC8Q8IU68 726 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NELFBQ8WX92 580 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 HAPLN2Q9GZV7 340 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT5AQ9NQR1 393 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 MAFFQ9ULX9 164 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB8Q9UN66 801 aa26.03■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A4O15374 487 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CBFA2T2O43439 604 aa26.02■■□□□ 1.76
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CAPNS1-216ENST00000628306 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPPQ6IPU0 288 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SEL1LQ9UBV2 794 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 USP18Q9UMW8 372 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD8Q9HCK8 2581 aa26.02■■□□□ 1.76
CAPNS1-216ENST00000628306 SFI1A8K8P3 1242 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 M0QZQ0 153 aa26.01■■□□□ 1.75
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CAPNS1-216ENST00000628306 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCCQ00597 558 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG1Q07617 926 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LPAL2Q16609 132 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0895Q8NCT3 520 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC3BQ96PB8 259 aa26.01■■□□□ 1.75
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CAPNS1-216ENST00000628306 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.01■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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CAPNS1-216ENST00000628306 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 OAZ2O95190 189 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TPM3P06753 285 aa26■■□□□ 1.75
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CAPNS1-216ENST00000628306 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB6Q15916 424 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCEQ6IPM2 695 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LEMD2Q8NC56 503 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 APPL2Q8NEU8 664 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 OLFML3Q9NRN5 406 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf42Q9NWW7 574 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 GMEB2Q9UKD1 530 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 HRO43593 1189 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TOM1L1O75674 476 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4Q2P0C623 313 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC13P31276 330 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR3P51677 355 aa25.99■■□□□ 1.75
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