RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592954.1

APOC4-202, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC4, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-202ENST00000592954 RBP5P82980 135 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 GAREM2Q75VX8 874 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 GCNAQ96QF7 691 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ANK1P16157 1881 aa14.5□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MAN2B1O00754 1011 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TNNC2P02585 160 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ATF6P18850 670 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CASP1P29466 404 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 AFMP43652 599 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CYP4F8P98187 520 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MYL7Q01449 175 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SMARCB1Q12824 385 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ADSSL1Q8N142 457 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 RDH13Q8NBN7 331 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 E2F7Q96AV8 911 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CFAP45Q9UL16 551 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 L1RE1Q9UN81 338 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.49□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 NCANO14594 1321 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 HOXD13P35453 343 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MYO1EQ12965 1108 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PKP1Q13835 747 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TTC8Q8TAM2 541 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 FAM3CQ92520 227 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 INTS13Q9NVM9 706 aa14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CLIC2O15247 247 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CDC25CP30307 473 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MAGEA9P43362 315 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 GPR15P49685 360 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CYP2J2P51589 502 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SURF1Q15526 300 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SDHAF4Q5VUM1 108 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 UNC13DQ70J99 1090 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 STKLD1Q8NE28 680 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 CLDN23Q96B33 292 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 HPDLQ96IR7 371 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 ACBD6Q9BR61 282 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TASP1Q9H6P5 420 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SIX4Q9UIU6 781 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TSC2P49815 1807 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 TCHHQ07283 1943 aa14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 PTPRJQ12913 1337 aa14.46□□□□□ -0.09
APOC4-202ENST00000592954 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms