RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584550.1

GGA3-219, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-219	ENST00000584550	RUNX3	Q13761	415 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	IL17A	Q16552	155 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PIGK	Q92643	395 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	IFT74	Q96LB3	600 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	BPTF	Q12830	3046 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	KCNE1	P15382	129 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	BCKDHB	P21953	392 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PRPH	P41219	470 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	EFNA5	P52803	228 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	BECN1	Q14457	450 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PDIA5	Q14554	519 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DMC1	Q14565	340 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PLIN2	Q99541	437 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CIT	O14578	2027 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	OAZ2	O95190	189 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	RPA1	P27694	616 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	GPR17	Q13304	367 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ECM1	Q16610	540 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	USP37	Q86T82	979 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550		M0QZQ0	153 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	FGF19	O95750	216 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	BMP15	O95972	392 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	DRD1	P21728	446 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SEC13	P55735	322 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PEX3	P56589	373 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	GRIN1	Q05586	938 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	PKP1	Q13835	747 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	TAF12	Q16514	161 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA3-219	ENST00000584550	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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