RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568153.1

CAPN3-218, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-218ENST00000568153 FAM167AQ96KS9 214 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FIZ1Q96SL8 496 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PCYT2Q99447 389 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 GPR20Q99678 358 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 GBP3Q9H0R5 595 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 DMAC2Q9NW81 257 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.7□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 K7ENM7 598 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CCP110O43303 1012 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 LRRN2O75325 713 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PPFIA4O75335 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CASP14P31944 242 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KRT9P35527 623 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CCNFP41002 786 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KIR3DL1P43629 444 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 NPTX2P47972 431 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CCZ1BP86790 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TNK2Q07912 1038 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ACVR2BQ13705 512 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 SYCP1Q15431 976 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KSR1Q8IVT5 923 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ABI1Q8IZP0 508 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TC2NQ8N9U0 490 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TCP11Q8WWU5 503 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 HVCN1Q96D96 273 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 MAML3Q96JK9 1138 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 SLC6A18Q96N87 628 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KCND1Q9NSA2 647 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TBX20Q9UMR3 447 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.69□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 A0A1W2PQJ5 194 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TTC26A0AVF1 554 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 DENND3A2RUS2 1198 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ASAP2O43150 1006 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ARHGAP6O43182 974 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CA12O43570 354 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 HBP1O60381 514 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 EXOC3O60645 756 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 CLEC3AO75596 197 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 AKAP3O75969 853 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TOMM70O94826 608 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ARL2P36404 184 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 KCNJ6P48051 423 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 NCKAP1LP55160 1127 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ZBED6P86452 979 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 STRN3Q13033 797 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 EMC2Q15006 297 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 PPP2R5AQ15172 486 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 FIGNQ5HY92 759 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPN3-218ENST00000568153 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms