RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 DAW1Q8N136 415 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TIPINQ9BVW5 301 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SMOC1Q9H4F8 434 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SCN1AP35498 2009 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 RNF40O75150 1001 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 F13A1P00488 732 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CLTAP09496 248 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NUCB2P80303 420 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP4F8P98187 520 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 RUNX3Q13761 415 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PKP1Q13835 747 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PDIA5Q14554 519 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 KYAT1Q16773 422 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZPBP2Q6X784 338 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 GKN1Q9NS71 199 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SPEGQ15772 3267 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ATRXP46100 2492 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 E9PMD0 336 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ZZEF1O43149 2961 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SOAT2O75908 522 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BMP15O95972 392 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C1QTNF9P0C862 333 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DRD1P21728 446 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PAX3P23760 479 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 AVPR1AP37288 418 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CREB5Q02930 508 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SPAG1Q07617 926 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MCL1Q07820 350 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BFSP1Q12934 665 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXC1Q12948 553 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MAPK7Q13164 816 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MGAT5BQ3V5L5 792 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO43Q4G163 708 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KRT79Q5XKE5 535 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ATL3Q6DD88 541 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TCEAL3Q969E4 200 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 BICD1Q96G01 975 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 HHIPQ96QV1 700 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC26A0AVF1 554 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CAVIN2O95810 425 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 PRPHP41219 470 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 NBR1Q14596 966 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C11orf74Q86VG3 221 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ACDQ96AP0 544 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 LPIN3Q9BQK8 851 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 EBF3Q9H4W6 596 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C4orf47A7E2U8 309 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SFI1A8K8P3 1242 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 H0YCG3 227 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 APBB3O95704 486 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 EGFP01133 1207 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 GBP1P32455 592 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB6Q15916 424 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC39A12Q504Y0 691 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 HPS4Q9NQG7 708 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 DSEQ9UL01 958 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms