RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 GCKRQ14397 625 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ODF1Q14990 250 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 D2HGDHQ8N465 521 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 IL17RAQ96F46 866 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CAPNS2Q96L46 248 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DNM3Q9UQ16 869 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 JAG2Q9Y219 1238 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MED23Q9ULK4 1368 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CA12O43570 354 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ENDOD1O94919 500 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SELENOPP49908 381 aa7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 HHEXQ03014 270 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 NOMO1Q15155 1222 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZSN1 163 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 Q6ZVL8 140 aa7.5□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 G2E3Q7L622 706 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 OR7D4Q8NG98 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 EDAQ92838 391 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DEF6Q9H4E7 631 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LAMB2P55268 1798 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 E2F8A0AVK6 867 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MCL1Q07820 350 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SPATS1Q496A3 300 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ODR4Q5SWX8 454 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 LCE4AQ5TA78 99 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CPA6Q8N4T0 437 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 NRG4Q8WWG1 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 HOOK2Q96ED9 719 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 C8orf49Q96NF6 230 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 COA1Q9GZY4 146 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 PER3P56645 1201 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 APBA1Q02410 837 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 NOGQ13253 232 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SEPT2Q15019 361 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 BEND3Q5T5X7 828 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF521Q96K83 1311 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 COL4A1P02462 1669 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 STC2O76061 302 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 MIEF2Q96C03 454 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-225ENST00000515835 CSRNP2Q9H175 543 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-225ENST00000515835 EPC1Q9H2F5 836 aa7.47□□□□□ -1.21
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