RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PNKPQ96T60 521 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MMS19Q96T76 1030 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXQ1Q9C009 403 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EPC1Q9H2F5 836 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 INTUQ9ULD6 942 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR81Q562E7 1941 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 C9IYK1 514 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EDIL3O43854 480 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 HSF2BPO75031 334 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MED24O75448 989 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MOCS3O95396 460 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 INSRRP14616 1297 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GLULP15104 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF8P28908 595 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LMAN1P49257 510 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT76Q01546 638 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LMNB2Q03252 620 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT17Q04695 432 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CETN1Q12798 172 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GIT2Q14161 759 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MYBPC2Q14324 1141 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NAB2Q15742 525 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R5EQ16537 467 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ECM1Q16610 540 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ALS2CLQ60I27 953 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CATSPER3Q86XQ3 398 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR152Q8TDT2 470 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 COG1Q8WTW3 980 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYGNQ8WXF5 182 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 COL26A1Q96A83 441 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RTKNQ9BST9 563 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF19AQ9NV58 838 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SPG21Q9NZD8 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS18Q9P253 973 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 IGF2RP11717 2491 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 MSH4O15457 936 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GAS7O60861 476 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP9AO75110 1047 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KA5O75582 802 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNT3O95395 438 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL14O95715 111 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ABL1P00519 1130 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NR3C1P04150 777 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SDHBP21912 280 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTN2P35609 894 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1AP35813 382 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCIP41743 596 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 STAT1P42224 750 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 NPEPPSP55786 919 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 DMWDQ09019 674 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNMA1Q12791 1236 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R5CQ13362 524 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCB4Q15147 1175 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHA7Q15375 998 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KA1Q15418 735 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-201ENST00000264640 HGSNATQ68CP4 663 aa7.54□□□□□ -1.2
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