RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CASZ1Q86V15 1759 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MYO1CO00159 1063 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TM9SF1O15321 606 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MSH4O15457 936 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SOAT2O75908 522 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CACNB3P54284 484 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SLC15A2Q16348 729 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RNF180Q86T96 592 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF410Q86VK4 478 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ELP3Q9H9T3 547 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 WDR91A4D1P6 747 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RASSF10A6NK89 507 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PFDN1O60925 122 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ATP6V1E1P36543 226 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRN2Q92932 1015 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MAGEB18Q96M61 343 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 APPL1Q9UKG1 709 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ATRNO75882 1429 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MPOP05164 745 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SELENONQ9NZV5 590 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CXCL11O14625 94 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 DIAPH2O60879 1101 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFS3O75489 264 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 GYPCP04921 128 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PLA2G4AP47712 749 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 BCAT1P54687 386 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PTK7Q13308 1070 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MCEEQ96PE7 176 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PIDD1Q9HB75 910 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 DPP3Q9NY33 737 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 M0R3G1 203 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SLC11A2P49281 568 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 BFSP2Q13515 415 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SEC23AQ15436 765 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ERO1BQ86YB8 467 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 SEPT3Q9UH03 358 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TLR2O60603 784 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PGM1P36871 562 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CREMQ03060 361 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 OPTNQ96CV9 577 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 HPDLQ96IR7 371 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 COG4Q9H9E3 785 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RAD18Q9NS91 495 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 MEGF6O75095 1541 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D4O60343 1298 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 VPS4BO75351 444 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PAEPP09466 180 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 COMTP21964 271 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 PSMA3P25788 255 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 TNFRSF8P28908 595 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 RANBP1P43487 201 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF394Q53GI3 561 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 DCAF6Q58WW2 860 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-201ENST00000261266 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms