RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 DAAM2Q86T65 1068 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX2Q9NPC8 291 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TRANK1O15050 2925 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM187AA6NFU0 413 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM253P0C7T8 217 aa27.97■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF19AQ9NV58 838 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GUA9 196 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 F8VZ95 297 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 DAPK3O43293 454 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 NR3C1P04150 777 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 Q7L0L9 218 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNF39Q9H2S5 420 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 IFFO1Q0D2I5 559 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35C1Q96A29 364 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TLCD1Q96CP7 247 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 YME1L1Q96TA2 773 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZD7Q9H5P4 517 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-201ENST00000246533 COL6A3P12111 3177 aa27.96■■■□□ 2.07
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CAPNS1-201ENST00000246533 K7ENM7 598 aa27.95■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEC16BQ96JE7 1060 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 TXLNGYQ9BZA5 131 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS4Q9HA82 394 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 GCNT4Q9P109 453 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 STK33Q9BYT3 514 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 INSL6Q9Y581 213 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD13P35453 343 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.062e-8■■□□□ 14
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