RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 IQGAP1P46940 1657 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PP2D1A8MPX8 630 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 VWA5AO00534 786 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 GLRA3O75311 464 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 PYGMP11217 842 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 S100A5P33763 92 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 RGS2P41220 211 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 MYBPC2Q14324 1141 aa7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 KRT87PA6NCN2 255 aa7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 BOLA3Q53S33 107 aa7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 IL31Q6EBC2 164 aa7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CPS1-201ENST00000233072 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.53□□□□□ -1.2
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CPS1-201ENST00000233072 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 NAMPTP43490 491 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 LLGL1Q15334 1064 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 ARL8AQ96BM9 186 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 HEATR9A2RTY3 570 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 USP38Q8NB14 1042 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 EHD4Q9H223 541 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 WHRNQ9P202 907 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 ASMTLO95671 621 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 DEFA3P59666 94 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 PPP4CP60510 307 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 NCALDP61601 193 aa7.52□□□□□ -1.21
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CPS1-201ENST00000233072 RNF180Q86T96 592 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 RNF135Q8IUD6 432 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 ZFP42Q96MM3 310 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 AMACRQ9UHK6 382 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 TBX20Q9UMR3 447 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 PRRG1O14668 218 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 VDRP11473 427 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 RANBP1P43487 201 aa7.52□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 NCKAP1LP55160 1127 aa7.52□□□□□ -1.21
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